Μοριακή ανίχνευση του γονιδίου Hsp60 του Helicobacter pylori στην στοματική κοιλότητα (Bachelor thesis)
Χάννας, Νικόλαος
This diploma thesis focused on finding the Helicobacter pylori Hsp60 gene. This gene encodes the Heat-Shock Protein 60 protein (HSP60), which generally prevents the destruction of heat-resistant proteins [20], displays gastroduodenal diseases, autoimmune disorders [26] but more specifically, HSP60 activates NF-kappaB thus causing interleukin-8 production to increase through the Toll-like receptors of gastric epithelial cells, with the consequence of gastric inflammation [2]. There is also a possibility that it is somehow related to the attachment of H. pylori to human gastric epithelial cells [25].
57 samples of oral wash were collected from a random sample of a general population aged 19-64, in which isolation of the bacterial DNA from two different kits was performed, first using the "Genomic DNA Purification Kit" and then using the "ExtractMe Genomic DNA Kit" reagent to verify the DNA isolation capability of the samples mouthwash. After the quantitative and qualitative determination of the bacterial DNA by the spectrophotometric method, the nested-PCR method was then applied to target the Hsp60 gene and finally, horizontal electrophoresis was performed on a 1.5% w/v agarose gel. It was found that using the "Genomic DNA Purification Kit", 5 out of 57 samples were found positive for H. pylori infection, corresponding to 8.7%, while using the "ExtractMe Genomic DNA Kit" 13 out of 57 samples were found positive, corresponding to 22.8%.
In conclusion, the percentages are relatively low, which may be due to the low number of samples, the good hygiene of the teeth participants, the multiple refrigeration-thaw cycles of the samples as used for other investigations, and the selection of the right DNA isolation kit that has greater sensitivity. The interesting presentation will expand our study with more samples to draw safer conclusions on both the reliability of detection methods and the rates of bacterial origin in the cavity mouth of people of general population.
Institution and School/Department of submitter: | Σχολή Επαγγελμάτων Υγείας και Πρόνοιας. Τμήμα Ιατρικών Εργαστηρίων. |
Keywords: | Heat-Shock Protein;Ελικοβακτηρίδιο του πυλωρού;Helicobacter pylori;Λοίμωξη;Ηλεκτροφόρηση;Θεραπεία |
Description: | Πτυχιακή εργασία - Σχολή Επαγγελμάτων Υγείας και Πρόνοιας - Τμήμα Ιατρικών Εργαστηρίων, 2017 (α/α 9308) |
URI: | http://195.251.240.227/jspui/handle/123456789/14030 |
Item type: | bachelorThesis |
General Description / Additional Comments: | Πτυχιακή εργασία |
Item language: | el |
Item access scheme: | account |
Institution and School/Department of submitter: | Σχολή Επαγγελμάτων Υγείας και Πρόνοιας. Τμήμα Ιατρικών Εργαστηρίων. |
Publication date: | 2017-12-15 |
Bibliographic citation: | Χάννας, Ν. (2017). Μοριακή ανίχνευση του γονιδίου Hsp60 του Helicobacter pylori στην στοματική κοιλότητα (Πτυχιακή εργασία). Αλεξάνδρειο ΤΕΙ Θεσσαλονίκης. |
Abstract: | Η παρούσα πτυχιακή επικεντρώθηκε στην εύρεση του γονιδίου Hsp60 του Helicobacter pylori. Το γονίδιο αυτό κωδικοποιεί την πρωτεΐνη Heat-Shock Protein 60 (HSP60), η οποία γενικά αποτρέπει την καταστροφή των πρωτεϊνών που βρίσκονται αντιμέτωπες με την θερμότητα [20], εμφανίζει γαστροδωδεκαδακτυλικά νοσήματα, αυτοάνοσες διαταραχές [26] αλλά και πιο ειδικά, η HSP60 ενεργοποιεί τους NF-kappaB προκαλώντας έτσι αύξηση της παραγωγής της ιντερλευκίνης-8 μέσω των Toll-like receptors των γαστρικών επιθηλιακών κυττάρων, με απότοκο την γαστρική φλεγμονή [2]. Επίσης, υπάρχει μια πιθανότητα να σχετίζεται κάπως με την προσκόλληση του H. pylori με τα ανθρώπινα γαστρικά επιθηλιακά κύτταρα [25].
Εξετάσθηκαν 57 δείγματα στοματικού εκπλύματος που συλλέχθηκαν από τυχαίο δείγμα γενικού πληθυσμού με ηλικιακό εύρος 19-64, στα οποία πραγματοποιήθηκε απομόνωση του βακτηριακού DNA από δύο διαφορετικά kit, πρώτα με τη χρήση του αντιδραστηρίου “Genomic DNA Purification Kit” και μετά με τη χρήση του αντιδραστηρίου “ExtractMe Genomic DNA kit” για την πιστοποίηση της ικανότητας απομόνωσης DNA από τα δείγματα στοματικού εκπλύματος. Αφού πρώτα γίνει ο ποσοτικός και ποιοτικός προσδιορισμός του βακτηριακού DNA με τη μέθοδο της φασματοφωτομετρίας, έπειτα εφαρμόσθηκε η μέθοδος της ενφωλεασμένης αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης (nested-PCR) για την στοχοθέτηση του γονιδίου Hsp60 και τέλος, πραγματοποιήθηκε οριζόντια ηλεκτροφόρηση σε πηκτή αγαρόζης 1,5% w/v. Διαπιστώθηκε ότι με τη χρήση του αντιδραστηρίου “Genomic DNA Purification Kit” βρέθηκαν 5 από τα 57 δείγματα θετικά στην λοίμωξη του H. pylori που αντιστοιχεί στα 8,7%, ενώ με τη χρήση του αντιδραστηρίου “ExtractMe Genomic DNA kit” ανιχνεύθηκαν 13 από τα 57 δείγματα θετικά που αντιστοιχεί στα 22,8%.
Εν κατακλείδι, τα ποσοστά είναι σχετικά χαμηλά που μπορεί να οφείλονται στον χαμηλό αριθμό των δειγμάτων, στην καλή υγιεινή των δοντιών των συμμετεχόντων, στους πολλαπλούς κύκλους ψύξης-απόψυξης των δειγμάτων καθώς χρησιμοποιήθηκαν για άλλες έρευνες και στην επιλογή του σωστού kit απομόνωσης DNA που να διαθέτει μεγαλύτερη ευαισθησία. Ενδιαφέρον, λοιπόν, θα παρουσιάσει να διευρύνουμε την μελέτη μας με περισσότερα δείγματα ώστε να εξαγάγουμε ασφαλέστερα συμπεράσματα τόσο για την αξιοπιστία των μεθόδων ανίχνευσης όσο και για τα ποσοστά επιπολασμού του βακτηρίου στη στοματική κοιλότητα ατόμων γενικού πληθυσμού. This diploma thesis focused on finding the Helicobacter pylori Hsp60 gene. This gene encodes the Heat-Shock Protein 60 protein (HSP60), which generally prevents the destruction of heat-resistant proteins [20], displays gastroduodenal diseases, autoimmune disorders [26] but more specifically, HSP60 activates NF-kappaB thus causing interleukin-8 production to increase through the Toll-like receptors of gastric epithelial cells, with the consequence of gastric inflammation [2]. There is also a possibility that it is somehow related to the attachment of H. pylori to human gastric epithelial cells [25]. 57 samples of oral wash were collected from a random sample of a general population aged 19-64, in which isolation of the bacterial DNA from two different kits was performed, first using the "Genomic DNA Purification Kit" and then using the "ExtractMe Genomic DNA Kit" reagent to verify the DNA isolation capability of the samples mouthwash. After the quantitative and qualitative determination of the bacterial DNA by the spectrophotometric method, the nested-PCR method was then applied to target the Hsp60 gene and finally, horizontal electrophoresis was performed on a 1.5% w/v agarose gel. It was found that using the "Genomic DNA Purification Kit", 5 out of 57 samples were found positive for H. pylori infection, corresponding to 8.7%, while using the "ExtractMe Genomic DNA Kit" 13 out of 57 samples were found positive, corresponding to 22.8%. In conclusion, the percentages are relatively low, which may be due to the low number of samples, the good hygiene of the teeth participants, the multiple refrigeration-thaw cycles of the samples as used for other investigations, and the selection of the right DNA isolation kit that has greater sensitivity. The interesting presentation will expand our study with more samples to draw safer conclusions on both the reliability of detection methods and the rates of bacterial origin in the cavity mouth of people of general population. |
Advisor name: | Παπουτσή , Ανδρονίκη |
Examining committee: | Παπουτσή, Ανδρονίκη |
Publishing department/division: | Τμήμα Ιατρικών Εργαστηρίων. |
Publishing institution: | teithe |
Number of pages: | 92 |
Appears in Collections: | Πτυχιακές Εργασίες |
Files in This Item:
There are no files associated with this item.
Please use this identifier to cite or link to this item:
This item is a favorite for 0 people.
http://195.251.240.227/jspui/handle/123456789/14030
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.